氣相色譜分析室:主要是對容易轉化為氣態(tài)而不分解的液態(tài)有機化合物及氣態(tài)樣品的分析。儀器設備主要有氣相色譜儀，具有計算機控制系統及數據處理系統，自動(dòng)化程度很高，對有機化合物具有卓效的分離能力，所用載氣主要有：
  H2、N2、Ar、He、CO2等。但對高沸點(diǎn)化合物，難揮發(fā)的及熱不穩定的化合物、離子化合物、高聚物的分離卻無(wú)能為力。要求局部排風(fēng)及避免陽(yáng)光直射在儀器上，避免影響電路系統正常工作的電場(chǎng)及磁場(chǎng)存在，一般設計：儀器臺（應離墻以便儀器維修）、萬(wàn)向排氣罩、電腦臺（一般在儀器臺旁配置）、邊臺、洗滌臺、試劑柜等
  液相色譜\分析室 :主要體現在高效率分離，對復雜的有機化合物分離制取純凈化合物，定量分析和定性分析，儀器設備主要有：高效液相色譜儀，適宜于高沸點(diǎn)化合物、難揮發(fā)化合物、熱不穩定化合物、離子化合物、高聚物等，彌補氣相色譜儀的不足。環(huán)境和實(shí)驗室基礎裝備設計要求與氣相色諳室相近。
  質(zhì)譜分析室: 主要是對純有機物的定性分析，實(shí)現對有機化合物的分子量、分子式、分子結構的測定，分析樣品可以是氣體、液體、固體，主要設備有質(zhì)譜儀、氣-質(zhì)聯(lián)用儀。質(zhì)譜儀是利用電磁學(xué)的原理，使物質(zhì)的離子按照基特征的質(zhì)荷比（即質(zhì)量m與電荷e之比—m/e）來(lái)進(jìn)行分離并進(jìn)行質(zhì)譜分析的儀器，缺點(diǎn)是對復雜有機混合物的分離無(wú)能為力。氣相色譜分離效率高，定量分析簡(jiǎn)便的特點(diǎn)，結合質(zhì)譜儀靈敏度高，定性分析能力強的特點(diǎn)，兩種儀器聯(lián)用為氣-質(zhì)聯(lián)用儀?？梢匀? 長(cháng)補短，提高分析質(zhì)量和效率。質(zhì)譜儀可能有汞蒸汽逸出，要考慮局部排風(fēng)。
  光譜分析室 :主要是根據物質(zhì)對光具有吸收、散射的物理特征及發(fā)射光的物理特性，在分析化學(xué)領(lǐng)域建立化學(xué)分析。主要的儀器是原子發(fā)射光譜儀、原子吸收光譜儀，分光光度計、原子熒光光譜儀、熒光分光光度計、X射線(xiàn)熒光儀、紅外光光譜儀、電感耦合等離子體（LCP）光譜儀、拉曼光譜儀等。實(shí)驗室應盡量遠離化學(xué)實(shí)驗室、以防止酸、堿、腐蝕性氣體等對儀器的損害，遠離輻射源；室內應有防塵、防震、防潮等措施。儀器臺與窗、墻之間要有一定距離，便于對儀器的調試和檢修。應設計局部排風(fēng)。使用原子吸收罩排風(fēng)較為適宜。
  以上實(shí)驗室，根據實(shí)際需要可設置樣品處理室，一般有洗滌臺、實(shí)驗臺、通風(fēng)柜等設備，同化學(xué)實(shí)驗室類(lèi)似。

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